Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3550W4VSN7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms