Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac6Q9Z2V5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac6Q9Z2V5 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac6Q9Z2V5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdac6Q9Z2V5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac6Q9Z2V5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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