Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl40Q9Z2Q5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl40Q9Z2Q5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl40Q9Z2Q5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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