Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vamp5Q9Z2P8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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