Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms