Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl8Q9Z121 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccl8Q9Z121 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccl8Q9Z121 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccl8Q9Z121 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms