Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms