Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bgrQ9WUZ7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bgrQ9WUZ7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms