Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms