Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TefQ9JLC6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefQ9JLC6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms