Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb3Q9JKS4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms