Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms