Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Usp29Q9ES63 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp29Q9ES63 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Usp29Q9ES63 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp29Q9ES63 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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