Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cse1lQ9ERK4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cse1lQ9ERK4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cse1lQ9ERK4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cse1lQ9ERK4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cse1lQ9ERK4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cse1lQ9ERK4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms