Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ndufs3Q9DCT2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ndufs3Q9DCT2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ndufs3Q9DCT2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ndufs3Q9DCT2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ndufs3Q9DCT2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ndufs3Q9DCT2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ndufs3Q9DCT2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms