Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cnot8Q9D8X5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cnot8Q9D8X5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot8Q9D8X5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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