Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Alkbh4Q9D8F1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms