Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slx4ipQ9D7Y9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms