Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3404Q9D506 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3404Q9D506 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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