Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ribc2Q9D4Q1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ribc2Q9D4Q1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms