Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snapc3Q9D2C9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snapc3Q9D2C9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms