Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nol3Q9D1X0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms