Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mms19Q9D071 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms