Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ccdc47Q9D024 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc47Q9D024 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc47Q9D024 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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