Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SdhdQ9CXV1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms