Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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