Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Tmed5Q9CXE7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmed5Q9CXE7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmed5Q9CXE7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmed5Q9CXE7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Tmed5Q9CXE7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Tmed5Q9CXE7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Tmed5Q9CXE7 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Tmed5Q9CXE7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Tmed5Q9CXE7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tmed5Q9CXE7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Tmed5Q9CXE7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Tmed5Q9CXE7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Tmed5Q9CXE7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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