Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms