Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rprd1bQ9CSU0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rprd1bQ9CSU0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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