Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms