Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Smim8Q9CQQ0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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