Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms