Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpa3Q9CQ71 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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