Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl17Q9CPR4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms