Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdac9Q99N13 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdac9Q99N13 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdac9Q99N13 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdac9Q99N13 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hdac9Q99N13 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Hdac9Q99N13 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Hdac9Q99N13 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Hdac9Q99N13 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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