Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4dQ99N05 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms