Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms