Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RtcbQ99LF4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms