Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sf3b5Q923D4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms