Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms