Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms