Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK0

Tmem30a, Cell cycle control protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30aQ8VEK0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem30aQ8VEK0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms