Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dkk4Q8VEJ3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms