Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smg8Q8VE18 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms