Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ttc8Q8VD72 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ttc8Q8VD72 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms