Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RfxapQ8VCG9 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RfxapQ8VCG9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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