Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GcaQ8VC88 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms