Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc12Q8R344 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms