Protein–RNA interactions for Protein: Q8K349

Gimap6, GTPase IMAP family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimap6Q8K349 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gimap6Q8K349 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gimap6Q8K349 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gimap6Q8K349 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gimap6Q8K349 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gimap6Q8K349 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gimap6Q8K349 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms