Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ssh3Q8K330 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms